Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms