Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RERGQ96A58 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RERGQ96A58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms