Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTSSAQ969W0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms