Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRIPQ8WXE1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms