Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN4CLQ8ND94 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN4CLQ8ND94 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms