Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms