Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAB1Q8N987 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAB1Q8N987 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms