Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms