Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms