Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms