Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
ATRAIDQ6UW56 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms