Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRC8EQ6NSJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms