Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms