Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms