Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACHD1Q5VU97 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACHD1Q5VU97 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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