Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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