Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms