Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CIRBPQ14011 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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