Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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