Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms