Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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