Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms