Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms