Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB4BP68371 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB4BP68371 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB4BP68371 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB4BP68371 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB4BP68371 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms