Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms