Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms