Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GALR1P47211 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GALR1P47211 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GALR1P47211 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms