Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
RANGAP1P46060 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms