Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A2P43354 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A2P43354 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms