Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPARGP37231 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPARGP37231 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPARGP37231 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPARGP37231 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms