Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP1P29466 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP1P29466 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP1P29466 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP1P29466 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP1P29466 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms