Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCM3P25205 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCM3P25205 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCM3P25205 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCM3P25205 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCM3P25205 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms