Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GCSHP23434 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GCSHP23434 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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