Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD33P20138 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD33P20138 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD33P20138 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD33P20138 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD33P20138 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD33P20138 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms