Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATF1P18846 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATF1P18846 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATF1P18846 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms