Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYF2O95926 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYF2O95926 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYF2O95926 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYF2O95926 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYF2O95926 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYF2O95926 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYF2O95926 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms