Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRXO43186 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRXO43186 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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