Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF5O00463 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms