Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms