Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms