Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms