Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POMPQ9Y244 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms