Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQSEC3Q9UPP2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms