Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms