Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms