Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms