Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSENENQ9NZ42 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms