Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYTL1Q9NRR1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYTL1Q9NRR1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYTL1Q9NRR1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms