Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS2Q9BXC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms