Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB3IPQ96QF0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms